59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1666 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1666  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3569  transcriptional regulator, PadR-like family  59.63 
 
 		 109 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1476  transcriptional regulator, PadR-like family  58.42 
 
 		 109 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3490  transcriptional regulator, PadR-like family  48.57 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5040  PadR-like family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5372  transcriptional regulator, PadR-like family  48.24 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2803  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  44.74 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3190  transcriptional regulator, PadR-like family  39.56 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0392978  normal  0.0453755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  46.43 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  42.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  37.78 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4803  transcriptional regulator, PadR family  37.78 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 117 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 136 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 108 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 111 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  38.03 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  36.36 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  42.22 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  36.23 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  36.96 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  33.77 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  29.55 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  47.06 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 115 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  33.96 
 
 		 114 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>