249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4325 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  216  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  51.55 
 
 		 113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  48.62 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  47.62 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  51.04 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  42.99 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  46.6 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  46.6 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 115 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  46.6 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  46.6 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  46.6 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  45.63 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  53.54 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  52.53 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  44.76 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  40.38 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  41.49 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  38.3 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  36.94 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  36.27 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  42.71 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  36.27 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  39.58 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  36.73 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  39.58 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  34.69 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  34.69 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  29.36 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  31.52 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  32.61 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  36.73 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  41.25 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  31.52 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  31.58 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  38.54 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  29.81 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>