More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1117 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 122 aa  244  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  64.22 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  59.26 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  59.81 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  43.64 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  49.47 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  43.16 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  43.33 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.81 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  32.99 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  34.26 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  42.35 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  31.68 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  42.11 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  29.82 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  33.03 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  39.05 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  40.62 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.94 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  34.19 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  32.22 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  39.51 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  28.04 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 125 aa  57  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  41.75 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>