More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0474 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 113 aa  224  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  44.34 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  41.12 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  49.47 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  39.39 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  39.62 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  40.22 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  37.66 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  37.66 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  37.89 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  37.25 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32.56 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  28.24 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  28.43 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  27.45 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  27.45 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  29.9 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  27.45 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.87 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  29.67 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  30.39 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  34.09 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  31.58 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  34.74 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>