196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1041 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  314  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  92.67 
 
 		 150 aa  297  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  93.33 
 
 		 150 aa  296  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  92 
 
 		 150 aa  294  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  92 
 
 		 150 aa  294  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  92 
 
 		 150 aa  294  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  92 
 
 		 150 aa  293  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  92 
 
 		 150 aa  293  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  92 
 
 		 150 aa  293  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  92 
 
 		 150 aa  293  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  91.33 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  46.59 
 
 		 129 aa  83.6  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  43.53 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  32.32 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  32.05 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  44.05 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  27.16 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  31.91 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  31.91 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  29.29 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  47.37 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  33.72 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  28.87 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  31.76 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  30.85 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  43.86 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  30.85 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  28.28 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  27.96 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  26.17 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  39.34 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  31.31 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  24.71 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  31.46 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  28.41 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  27.78 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  29.11 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  30.39 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  30 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  26.21 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>