250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0311 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  46.23 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  48.11 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  40.38 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  35.24 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  35.24 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  35.24 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  35.24 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  35.24 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  35.24 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  30.93 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  37.18 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1031  transcriptional regulator, PadR family  31.13 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97206e-22 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0857  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0432305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0845  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1118  transcriptional regulator, PadR family  31.13 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  37.66 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  37.66 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  37.66 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  37.66 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  43.28 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  37.66 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0849  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0891  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0947  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  33.7 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  36.47 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  34.31 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  31.94 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  36.36 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  30.69 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  32.61 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  30.11 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 372 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  32.47 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  32.47 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  32.47 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  30.11 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>