More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2223 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 372 aa  764    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  65.18 
 
 		 152 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  43.93 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 155 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  45.45 
 
 		 107 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 111 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 127 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 113 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 114 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 118 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 166 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 99 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 203 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 263 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 176 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 157 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  30.77 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 118 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 		 195 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 200 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 125 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 229 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  41.43 
 
 		 183 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 128 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 128 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  43.55 
 
 		 124 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  34.18 
 
 		 118 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 117 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  34.72 
 
 		 191 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 119 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 128 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  33.33 
 
 		 99 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 154 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 124 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 		 226 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 110 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 110 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 123 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 204 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 114 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 110 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 124 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 109 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 150 aa  53.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 150 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 160 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0020  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 114 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 247 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 150 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 157 aa  52.8  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 151 aa  52.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 108 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  34.41 
 
 		 110 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 115 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 195 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  40.48 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  34.25 
 
 		 197 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 134 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 111 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 122 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 110 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  34.41 
 
 		 110 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  31.51 
 
 		 191 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 110 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 110 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  44.83 
 
 		 103 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 121 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 121 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 116 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  25.23 
 
 		 111 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  33.73 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>