164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0276 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  51.96 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  33.33 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  33.33 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  33.87 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  33.87 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  37.14 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  36.7 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  38.14 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  39.76 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  36.73 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  37.5 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 109 aa  47.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  32.88 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32.1 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  38.27 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  36.05 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0849  PadR-like family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  38.36 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  34.15 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  34.15 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  29.17 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 203 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1031  transcriptional regulator, PadR family  27.1 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97206e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  30.11 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  34.33 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  25.71 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 102 aa  43.9  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  29.87 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  32.5 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  32.5 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  32.5 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  32.5 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>