199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0705 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  213  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  58.49 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  59.38 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 119 aa  100  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  58.59 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  54.63 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  55.32 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  47.62 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  57.14 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  51.72 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  51.52 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  49.43 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  39.58 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  41.76 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  38 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  40.66 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  37.76 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  40.66 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  37 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  40.21 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  37 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  39.56 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  39.56 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  40.66 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  39.56 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  38 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  44.21 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  35.51 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  38.14 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  36.08 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  45.26 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  48.57 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 240 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  37.18 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  44.05 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  35.82 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  40.7 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  44.62 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  29.76 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  42.25 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  32.56 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  34.21 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  34.21 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>