118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  62.5 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  55.88 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  47.86 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  50.47 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  43.8 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  41.12 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  46.74 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  46.05 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  37.11 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  34 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  34.69 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  34.69 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  34.69 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  34.69 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  34.69 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  37.76 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  37.61 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  37.89 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  31.96 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  32.58 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  30.69 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  29.91 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  35.37 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  29.91 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  35.37 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  34.33 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  26.32 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  34.88 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  44.07 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3569  transcriptional regulator, PadR-like family  29.57 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  46.97 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 119 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 111 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  34.21 
 
 		 126 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  33.93 
 
 		 124 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  28.97 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>