278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0180 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  76.47 
 
 		 114 aa  157  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  64.08 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  60.61 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  58.16 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  57.84 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  63.22 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  55 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  49.17 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  43.8 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  57.5 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  49.35 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  43.04 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  38.24 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  42.68 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  42.68 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  42.68 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  42.68 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  36.56 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  36.56 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  41.75 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  41.05 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  41.58 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  47.14 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  35.34 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  36.67 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  32.41 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  58 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 123 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  40.74 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  28.28 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  43.37 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  30.85 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  41.43 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  42.35 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>