186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3679 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  226  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  226  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  69.61 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  63.3 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  66.34 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  60.2 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  57.01 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  61.62 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  105  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  56.19 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  47.41 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  52.87 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  53.95 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  41.38 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  39.58 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  44.59 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.77 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  35.96 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  41.05 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  30.21 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  35 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  28.72 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  36.46 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  35 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  43.66 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  40.26 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  43.16 
 
 		 183 aa  50.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  41.98 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  36.67 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  31 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 372 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  43.55 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  40.51 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  38.95 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  40.85 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  32.05 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  27.17 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  38.04 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  30 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>