253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3603 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  224  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  77.88 
 
 		 113 aa  180  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  34 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  40.2 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  44.79 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  39.81 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  29.63 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  32.65 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  30.3 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  36.08 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  34.55 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  31.13 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  26.17 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  26.21 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  32.71 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.13 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  32.35 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  35 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  27.62 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  37.74 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  26.04 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  29.9 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  30.34 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  27.62 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  35.96 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  26.37 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  27.62 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  34.12 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  33.96 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>