More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4285 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 113 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 109 aa  130  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  57.8 
 
 		 113 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  45.54 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  43 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  31.96 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35.05 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  36.63 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  38.78 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  28.71 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  34.12 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  31 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.67 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  29.7 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  40.23 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  30.3 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  28.16 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  28.16 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  28.16 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  28 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 372 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  29.41 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  28.57 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>