More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3967 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  313  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  65.18 
 
 		 372 aa  160  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  42.57 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  30.43 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  34.02 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  40.22 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  39.53 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  32.73 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  29.36 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  29 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 238 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  37.5 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  30.68 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.62 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>