288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0964 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 
121 aa  253  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  42.57 
 
 
152 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 
123 aa  66.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  30.85 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 
210 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 
175 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  34.95 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  38.16 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  27.84 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 
116 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  36.71 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  30.85 
 
 
128 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  45.9 
 
 
277 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 
263 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  37.89 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 
250 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  28.72 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 
191 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 
217 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  39.44 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  31.31 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 
226 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
204 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 
230 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  31.37 
 
 
203 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  28.71 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 
238 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 
206 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
176 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  26.51 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
219 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  35.38 
 
 
123 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 
150 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  29.17 
 
 
334 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  39.73 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  34.25 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 
209 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 
209 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  28.12 
 
 
250 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
268 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 
236 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  38.36 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 
255 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  32.93 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 
219 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 
219 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  27.27 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  26.73 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  34.18 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  38.71 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 
195 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  36.62 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>