More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2897 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 110 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 188 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  36.79 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  38.83 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  38.14 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  37.23 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  37.37 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  36.7 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  30.91 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  31.07 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  29.36 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  28.3 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  43.18 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 372 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  28.07 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  28.71 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  28.85 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  34.02 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  29.81 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  29.9 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>