268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1087 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  225  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  77.88 
 
 		 113 aa  165  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  57.8 
 
 		 110 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  53 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  49 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  53 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  34.04 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  33.02 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  43.43 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  33.93 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  32.22 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  41.35 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  33.02 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  40.78 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  31.13 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  31.07 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  39.18 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  34.51 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  33.66 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  26.17 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  33.02 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  27.45 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  27.93 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  31.78 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  31.31 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  28.42 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  36.08 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  41.18 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  34.12 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  26.13 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  34.31 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  26.26 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  26.37 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  30.84 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  25.24 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  25.24 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  27.36 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>