More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8023 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 178 aa  341  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  52.33 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  49.42 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  47.98 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  33.6 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  36.63 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  33.72 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  34.1 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  41.82 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  45.65 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  41.25 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  47.56 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  47.44 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  31.98 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 272 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  49.12 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  54.72 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  40.74 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  50.98 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  50.98 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  38.58 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  24.38 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  27.38 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  44.74 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  44.3 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  23.75 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  43.21 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 130 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  43.59 
 
 		 123 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  41.25 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 108 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 113 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 107 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  45.31 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 111 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 110 aa  51.6  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  36.5 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  23.75 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 334 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 121 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  44.3 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 174 aa  50.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 113 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  23.75 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 110 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  23.75 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  23.75 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  23.75 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  45 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  22.73 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  37.21 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  34.4 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>