106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4200 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  55.87 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  62.22 
 
 		 212 aa  217  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  54.04 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  55.12 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  54.63 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  53.03 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  56.98 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  56 
 
 		 229 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  51.96 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  58.19 
 
 		 272 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  49.5 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  51.98 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 249 aa  161  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  49.03 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  51.79 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  53.41 
 
 		 181 aa  134  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  50.86 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  47.03 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  47.57 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  45.36 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.38 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  27.33 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  27.91 
 
 		 165 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  26.16 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  25.58 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  25.58 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  25.58 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  25.58 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  25.58 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  36.43 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  40.23 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  44.87 
 
 		 118 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 108 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  36.5 
 
 		 178 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  27.32 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 		 168 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 372 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  31.33 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 125 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  35.56 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 107 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  39.76 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 131 aa  45.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 114 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 110 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  27.12 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  27.6 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  40.28 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  34.62 
 
 		 112 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 109 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 134 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 179 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 150 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 204 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 175 aa  42  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2542  hypothetical protein  25.25 
 
 		 113 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>