82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0813 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 201 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  36.52 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  37.43 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  39.56 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  36.11 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 220 aa  95.5  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  35 
 
 		 203 aa  94.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  35.2 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  29.7 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  39.55 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  29.55 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  30.32 
 
 		 185 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  30.43 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  30.32 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  29.95 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  30.17 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  33.13 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  31.54 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  29.06 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  27.41 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  32.67 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  34.67 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  31.03 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 272 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  34.13 
 
 		 178 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  32.21 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  37.89 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  34.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  32.39 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.59 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 242 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  27.21 
 
 		 186 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>