92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0121 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  89.95 
 
 		 190 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  89.42 
 
 		 190 aa  341  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  86.84 
 
 		 190 aa  330  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  86.84 
 
 		 190 aa  330  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  86.84 
 
 		 190 aa  330  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  86.32 
 
 		 190 aa  330  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  62.77 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  64.89 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  48.39 
 
 		 226 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  42.62 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  43.17 
 
 		 215 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 232 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  40.98 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  38.25 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  37.2 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 253 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  35.83 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  32.28 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  34.59 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.9 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  26.55 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.7 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  36.07 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  31.95 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  22.68 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  32.53 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  23.74 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  22.4 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  29.51 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  23.71 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  21.98 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  35.87 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  23.62 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  23.62 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  31.61 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  30.72 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  23.62 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  39.47 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  23.03 
 
 		 325 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  34.21 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  33.52 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  28.18 
 
 		 187 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  29.67 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 240 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>