117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3549 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  42.13 
 
 		 203 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  41.97 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  44.5 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  41.24 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  40.21 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  38.62 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 180 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  42.46 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  39.11 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 190 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  38.37 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 210 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 187 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  40.16 
 
 		 201 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  30.98 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  26.89 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  26.89 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  26.59 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  31.09 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  26.89 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  27.98 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  26.89 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  27.81 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  26.05 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  26.05 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  26.05 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  26.05 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  29.77 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  25.55 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  31.03 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  30.11 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 115 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  26.14 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 124 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  27.71 
 
 		 174 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  34.94 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  31.62 
 
 		 191 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 121 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 109 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  27.54 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  32.91 
 
 		 111 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  30.77 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 114 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  28.42 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  29.67 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  41.77 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 108 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  29.91 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 148 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>