71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4892 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  45.08 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 190 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  35.39 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  30.6 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  27.07 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  28.26 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  28.49 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  27.69 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  30.3 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  27.08 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  29.89 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  27.22 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  26.7 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  22.22 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  23.24 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  23.24 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  23.24 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  22.22 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  23.24 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  22.22 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  22.7 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  22.22 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  31.03 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  29.77 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  27.27 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  26.78 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  26.85 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  29.25 
 
 		 99 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  24.35 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 118 aa  42.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  34.88 
 
 		 184 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  23.5 
 
 		 206 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  25.56 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 174 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  28.68 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>