106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4580 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  54.12 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  51 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  42.13 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  43.63 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  41.54 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 253 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  39.06 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  39.23 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 180 aa  124  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  38.33 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  32.96 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  32.54 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  44.17 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  32.42 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  27.37 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  25.88 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  30.83 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  27.14 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  27.14 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  27.21 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  27.14 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  27.21 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  28.06 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 272 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  28.47 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.5 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  29.24 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 		 249 aa  48.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  27.48 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  34.4 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  22.99 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  30.12 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  33.08 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  34.88 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  23.3 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  27.01 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30.83 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  35.24 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  26.61 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  24.24 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  29.55 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  25.95 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  27.6 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4202  transcriptional regulator, PadR-like family  32.17 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  25.86 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  30.51 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 175 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  25.95 
 
 		 165 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  25.95 
 
 		 165 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  25.95 
 
 		 165 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 121 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 124 aa  42  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>