144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4562 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  96.23 
 
 		 212 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  64.64 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  65.95 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  54.55 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  58.66 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  58.19 
 
 		 201 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  52.91 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  50.48 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  51.44 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  51.24 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  59.68 
 
 		 252 aa  187  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  60.66 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  51.98 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 272 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 202 aa  181  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  63.69 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  58.47 
 
 		 180 aa  175  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  59.78 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 203 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  55.37 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.1 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.57 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  39.6 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  25.97 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  25.97 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  25.97 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  25.97 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  25.97 
 
 		 165 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  25.84 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  24 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  23.5 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  28.89 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  25.13 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  23.5 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 177 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  26.87 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  23.5 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  21.69 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  27.53 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  21.69 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2398  hypothetical protein  28.26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0399809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2573  hypothetical protein  28.26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 372 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2382  PadR-like family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.886804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  28.74 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 172 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2542  hypothetical protein  28.26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  25.36 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  27.91 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  26.24 
 
 		 179 aa  45.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2314  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 113 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2585  hypothetical protein  28.26 
 
 		 113 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46974e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  35.29 
 
 		 271 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2577  hypothetical protein  27.17 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000426616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  26.8 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 103 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 118 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  29.66 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2627  hypothetical protein  26.67 
 
 		 101 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000391124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  44.23 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>