226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2577 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2577  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  223  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000426616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2542  hypothetical protein  97.35 
 
 		 113 aa  218  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2382  PadR-like family transcriptional regulator  97.35 
 
 		 113 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.886804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2314  transcriptional regulator  96.46 
 
 		 113 aa  216  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2585  hypothetical protein  96.46 
 
 		 113 aa  216  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46974e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2398  hypothetical protein  97.35 
 
 		 113 aa  215  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0399809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2573  hypothetical protein  97.35 
 
 		 113 aa  215  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2627  hypothetical protein  97.03 
 
 		 101 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000391124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2351  PadR family transcriptional regulator  96.04 
 
 		 101 aa  192  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000125043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  31.37 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  31.73 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  30.77 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  31.78 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  30.77 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  30.77 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  33.96 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  37.37 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  33.98 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  27.72 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  32.65 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  33.01 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  33.01 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  32.65 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  38.2 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  38.2 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  38.2 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  38.2 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  38.2 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  38.2 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  38.2 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  32.61 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  28.71 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  31.07 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  32.29 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  35.63 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  29.41 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  30.28 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  29.41 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  32.95 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  31.46 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  38.38 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>