75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3358 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  70 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  69.35 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  63.86 
 
 		 202 aa  254  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  57.28 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  56.25 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  59.39 
 
 		 213 aa  221  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  55.12 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  54.31 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  58.89 
 
 		 199 aa  207  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  52.6 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  51.24 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  53.07 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  47.78 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  53.09 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  50.77 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  47.67 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 181 aa  147  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  46.11 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  45.55 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  42.72 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  24.37 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  32.48 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  37.61 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  24.74 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  55.77 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  42.67 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  24.21 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  24.21 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  24.21 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  24.21 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  24.21 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  45.31 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  28.02 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  27.88 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  40.32 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  30.84 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  45.1 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  34.55 
 
 		 109 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  48 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  48 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 174 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 110 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2649  PadR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 207 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00573866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 179 aa  42  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  36.49 
 
 		 174 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 189 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  26.94 
 
 		 175 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 107 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  27.62 
 
 		 174 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  27.32 
 
 		 178 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 174 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 372 aa  41.6  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 110 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>