103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3181 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 177 aa  357  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  64.37 
 
 		 176 aa  225  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  57.14 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  47.98 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  31.21 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  33.02 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  35.34 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  35.78 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  32.77 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  32.48 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 272 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  31.34 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  35.16 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  32.71 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  35.16 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  44.23 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  31.53 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  21.71 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.03 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  21.14 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  21.71 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  21.71 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  21.71 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  21.71 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 121 aa  50.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  21.14 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 118 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  21.14 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 203 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  29.84 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 110 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  27.52 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  23.74 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  28.44 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  30.67 
 
 		 112 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 113 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 121 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 208 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  29.17 
 
 		 123 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  27.4 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 204 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  28.17 
 
 		 114 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 250 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 249 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  30.99 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 121 aa  41.2  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  26.92 
 
 		 111 aa  41.2  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  30.58 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  25 
 
 		 109 aa  40.8  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  25 
 
 		 109 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 182 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  25 
 
 		 107 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  31.78 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>