170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4159 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 176 aa  344  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  68.12 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  56.44 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  53.85 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  52.44 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  50.6 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  51.88 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  47.85 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  47.67 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  49.38 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  42.86 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  35.58 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 168 aa  84.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  36.48 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  33.74 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  31.49 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  35.47 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  33.13 
 
 		 222 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  33.13 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  33.53 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  27.96 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  29.34 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  41.56 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  36.76 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  39.02 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  35.23 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  29.68 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  34.57 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  27.13 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  36.49 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 126 aa  51.6  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  30.99 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  33.77 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  25.32 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  37.84 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  26.7 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  23.72 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  23.12 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  40.58 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  36.26 
 
 		 108 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  25.51 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  28.24 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  22.44 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  33.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  28.82 
 
 		 242 aa  47.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  27.84 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 123 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  28.14 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  28.05 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  27.84 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  23.12 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  31.74 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36.62 
 
 		 107 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  33.72 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>