175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0301 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  79.89 
 
 		 174 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  78.57 
 
 		 174 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  74.14 
 
 		 174 aa  271  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  74.42 
 
 		 174 aa  266  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  75 
 
 		 174 aa  260  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  68.24 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  57.49 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  58.96 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  57.56 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  55.77 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  50.62 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  50.3 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  45 
 
 		 183 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  35.68 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  33.89 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 194 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  36.42 
 
 		 222 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  35.84 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  34.46 
 
 		 210 aa  84.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  34.86 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  33.53 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  32.8 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  26.26 
 
 		 305 aa  60.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  31.98 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  28.75 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  31.01 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  30.34 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  31.2 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  30.23 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  44.93 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  24.57 
 
 		 325 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  32.56 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  28.24 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  24.54 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 215 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  33.82 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  33.82 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  27.78 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  28.49 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  31.87 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  37.5 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  33.82 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 253 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  26.16 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>