168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4160 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  71.49 
 
 		 200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  56.8 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  61.05 
 
 		 179 aa  207  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  61.27 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  53.26 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  59.76 
 
 		 175 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  57.3 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  48.22 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  47.67 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  36.97 
 
 		 168 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  37.28 
 
 		 174 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  38.42 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 174 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 168 aa  98.2  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 174 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  37.06 
 
 		 175 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  36.42 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 174 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  34.32 
 
 		 179 aa  88.6  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  35.43 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  33.74 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  32.68 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  33.14 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  34.4 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  32.78 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  32.88 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  37.14 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  37.86 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  31.63 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  30.6 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 176 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  32.46 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  30.64 
 
 		 177 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 184 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  31.07 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  27.08 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  25.38 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  40.85 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  26.01 
 
 		 325 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  30.18 
 
 		 168 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  32.09 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  30.52 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  27.97 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  22.94 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  42.19 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 116 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 111 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  34.65 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 111 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  29.41 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  26.86 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>