152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1331 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 173 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  65.32 
 
 		 173 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  65.32 
 
 		 173 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 175 aa  197  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  45.93 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  47 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  30.99 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  43.56 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  44 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  31.51 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  31.71 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  32.09 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  43.37 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  28.02 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  32.73 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  31.52 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  42.22 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  29.03 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  28.89 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  39.24 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  32.99 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  31.08 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 305 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  28.15 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  28.33 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  34.92 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  44.3 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  28.15 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  35.71 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  30.39 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  28.14 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  37.74 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  30.25 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  28.17 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  30.34 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  32.67 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  30.72 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2796  PadR-like family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  40.74 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  29.46 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  32.17 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  38.75 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  26.06 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  30.67 
 
 		 334 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  33.72 
 
 		 255 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>