162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0828 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  81.4 
 
 		 179 aa  290  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  62.43 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  56.8 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  55.5 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  59.66 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  59.09 
 
 		 175 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  53.97 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  46.38 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  44.32 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  37.57 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  35.26 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  37.85 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  36.42 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  35.84 
 
 		 175 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 170 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  35.68 
 
 		 176 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  35.75 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 183 aa  88.6  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 175 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 168 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  33.52 
 
 		 177 aa  84.7  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  30.51 
 
 		 179 aa  84.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  34.32 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  32.6 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  32.08 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  31.49 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25.63 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  45.71 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  34.43 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  29.61 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  23.79 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  31.86 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  30.6 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  28.9 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  27.09 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  28.42 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  32.8 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 334 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  23.26 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  32.09 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  41.54 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  21.84 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  28.91 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 255 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 		 277 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 238 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  32.64 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  32.47 
 
 		 107 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  32.67 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  26.84 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  33.72 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  26.88 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>