145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0701 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  61.58 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  57.3 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 179 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  53.97 
 
 		 202 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 194 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  50.46 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  57.53 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  53.72 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  46.04 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  38.29 
 
 		 174 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 174 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  34.86 
 
 		 174 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  34.86 
 
 		 176 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  35.43 
 
 		 174 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.89 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 183 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 175 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  32.91 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  29.03 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  27.75 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  36.52 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  30.23 
 
 		 177 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  26.6 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  29.19 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  50.98 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  30.98 
 
 		 176 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  39.77 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  31.63 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 173 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  34.41 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  26.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  48.08 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  50.98 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  34.51 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  32.58 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  30.17 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  45.28 
 
 		 334 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1000  hypothetical protein  73.33 
 
 		 464 aa  48.5  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107007  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  28.1 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  43.14 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  52.17 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2099  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  36.11 
 
 		 537 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  29.35 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  21.65 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  43.4 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  41.38 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  32.46 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  29.91 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  30.87 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  37.97 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>