154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4876 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 213 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  48.19 
 
 		 218 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 213 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 213 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 213 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 213 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 213 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 190 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 190 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 190 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 190 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 190 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 190 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 180 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  45.26 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  42.62 
 
 		 204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  38.62 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  39.23 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  39.89 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  40.93 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  37.16 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  39.01 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  32.04 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  37.43 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  27.89 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  26.52 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  26.52 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  27.37 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 185 aa  72  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  25.26 
 
 		 185 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  25.26 
 
 		 185 aa  72  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  25.26 
 
 		 185 aa  72  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  28.3 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  31.29 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  35 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  35 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  28.81 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  27.22 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  38.58 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  34.82 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 115 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  26.9 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 122 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  39.81 
 
 		 125 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 123 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  27.73 
 
 		 114 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 114 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 121 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 112 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  41.46 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 112 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 107 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  39.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 111 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  24.14 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 108 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 114 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 116 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 121 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.44 
 
 		 165 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  43.04 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 185 aa  48.5  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  41.98 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 111 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  26.11 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  27.75 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  38.74 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>