93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0957 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  45.5 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  43.01 
 
 		 232 aa  140  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  42.62 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  42.46 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  39.06 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 190 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  35.6 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  37.43 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  34.83 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  37.57 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  33.88 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  33.53 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  45.07 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  45.07 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  25.54 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  25.14 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  25.82 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  25.27 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  24.46 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  24.46 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  24.57 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  24.57 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  25.62 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  42.47 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 111 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  29.82 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  26.32 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  26.19 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  29.21 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 121 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  48.98 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  45 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32.1 
 
 		 114 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  26.51 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 114 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 114 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 114 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 116 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  30.85 
 
 		 110 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  32.86 
 
 		 112 aa  42  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  34.12 
 
 		 250 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 109 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 255 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>