73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5591 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  50.97 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  45.26 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  42.36 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  35.6 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  35.12 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  33.52 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  34.05 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  34.08 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  34.43 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  34.64 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  24.16 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  26.23 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  31.84 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  23.03 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  21.91 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  22.47 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  22.47 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  22.47 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  27.37 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  22.47 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  21.35 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  21.35 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  29.01 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  27.62 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  36.05 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  31.4 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  30.73 
 
 		 176 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 177 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  26.55 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  29.63 
 
 		 187 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 170 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 168 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  23.35 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 119 aa  41.6  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>