152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3685 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  45.5 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  40.33 
 
 		 232 aa  131  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  39.89 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  38.33 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  39.11 
 
 		 232 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  38.76 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  37.57 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 190 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  37.08 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  95.9  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  34.05 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  34.68 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  25.82 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  25.27 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  25.14 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  25.71 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  25.14 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  25.14 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  25.14 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  25.86 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  31.58 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  29.03 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 114 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 136 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 113 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  56.25 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  43.9 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 249 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 121 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 316 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 111 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  34.88 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  26.67 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  35.25 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  31.4 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  29.52 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  33.72 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 114 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  40.24 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  38.14 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 109 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  29.46 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>