89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5813 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  66.5 
 
 		 198 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  51 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  43.3 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 253 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  45.4 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  40.31 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  38.5 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  39.51 
 
 		 215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 180 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  45.24 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  36.42 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  30.39 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  32.62 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  36.89 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  33.95 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  40.96 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  31.93 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  31.93 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  35.92 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  28.47 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  28.47 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  28.47 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  29.23 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  35.96 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  37.38 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  30.11 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  38.46 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  26.47 
 
 		 165 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  25.7 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  30.61 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  30.33 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4202  transcriptional regulator, PadR-like family  30.18 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  32.74 
 
 		 249 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 120 aa  44.7  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 165 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  24.43 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 272 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  28.67 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  29.57 
 
 		 205 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  29.73 
 
 		 212 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.13 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>