32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4202 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4202  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 197 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  45.15 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  36.65 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  38.4 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  31.18 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  34.57 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  28.72 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  31.98 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  34.71 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  31.33 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  28.89 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  30.09 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  34.57 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  34.57 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  34.57 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  22.31 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  29.66 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>