40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1446 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  44.1 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4202  transcriptional regulator, PadR-like family  45.15 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 187 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  34.92 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  30.56 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  27.81 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  27.03 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  31.54 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  27.09 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  23.98 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  26.19 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  26.61 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  27.96 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  33.04 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  30.28 
 
 		 175 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  24.52 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>