94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8807 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  47.32 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  43.46 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  42.36 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  36.87 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  36.41 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  38.32 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  34.64 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  35 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  30 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  33.94 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  23.6 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  23.03 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  34.15 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  21.91 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  21.91 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  21.91 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  27.81 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  28.96 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  22.05 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  22.05 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  35.36 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  21.91 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  21.91 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  32.02 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  23.76 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  31.32 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  28.47 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  24.27 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  25.28 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  29.21 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  27.46 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  25.26 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  35.45 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 154 aa  45.1  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  28.99 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  26.6 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  29.14 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  27.97 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  30.9 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  25.93 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  32.34 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  42.22 
 
 		 190 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 183 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 136 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  41.25 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  34.44 
 
 		 107 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>