98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3830 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  384  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  87.03 
 
 		 185 aa  338  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  85.95 
 
 		 185 aa  334  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  85.41 
 
 		 185 aa  330  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  85.41 
 
 		 185 aa  330  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  85.95 
 
 		 185 aa  330  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  84.86 
 
 		 185 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  84.86 
 
 		 185 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  85.25 
 
 		 185 aa  324  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  85.25 
 
 		 185 aa  324  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  45.36 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  44.26 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  28.18 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  34.43 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  27.01 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  26.84 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  25.93 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  30.99 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  26.05 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  28.15 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  22.56 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  27.18 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  24.7 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  20.77 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  19.53 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  22.94 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  27.63 
 
 		 215 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  22.95 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  24.57 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  19.77 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  23.61 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  23.29 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  23.3 
 
 		 252 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  22.41 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  24.86 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  29.3 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  26.89 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 212 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  23.33 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  20.99 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  20.79 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  22.51 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 119 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  22.86 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  32.47 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  27.07 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 204 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 272 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  22.41 
 
 		 212 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 181 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  24.31 
 
 		 176 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  28.26 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  28.26 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  24.11 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  25.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  23.76 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  23.58 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  22.38 
 
 		 255 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  27.03 
 
 		 249 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  22.95 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>