125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3567 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  69.2 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  73.66 
 
 		 212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  68.13 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  59.9 
 
 		 227 aa  244  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  66.86 
 
 		 201 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  62.5 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  66.29 
 
 		 229 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  59.6 
 
 		 202 aa  224  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  59.39 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 272 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  60.56 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  56.57 
 
 		 203 aa  204  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  53.5 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  65.32 
 
 		 181 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  63.37 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  49.78 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 181 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  52.61 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  60.45 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  56.98 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  51.28 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  56.98 
 
 		 180 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  54.97 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  53.41 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  26.79 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  26.79 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  38.18 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  25.6 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  36.94 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  25.6 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  25.6 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  25.6 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  25.6 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  34.55 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  27.98 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  36.63 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 157 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  40.7 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 107 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  37.89 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 108 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 113 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  28.14 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 162 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 113 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  29.76 
 
 		 325 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  27.96 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  34.41 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 118 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 121 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  28.68 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  28.99 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  30.94 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  26.67 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  25.19 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  31.46 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  35.79 
 
 		 103 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  31.94 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>