107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1487 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  66.5 
 
 		 198 aa  250  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  54.12 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  46.96 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  44.5 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  50.28 
 
 		 253 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  42.47 
 
 		 215 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 220 aa  97.1  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  32.74 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  37.57 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  42.06 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  34.86 
 
 		 218 aa  91.3  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  34.68 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  34.91 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  36.46 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  33.33 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  33.33 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  34.17 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  33.08 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  28.09 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  27.52 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 118 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  30.81 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  29.22 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  36.67 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 120 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.72 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  28.07 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  29.57 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  26.9 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4202  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  26.52 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  31.4 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.29 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 117 aa  42.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  31.33 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  31.62 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 134 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>