91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_3036 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  92.34 
 
 		 210 aa  362  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 190 aa  230  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  62.77 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 190 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  60.85 
 
 		 190 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  60.85 
 
 		 190 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  60.85 
 
 		 190 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 190 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  50.97 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  47.26 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  40.21 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  40.32 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  38.74 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  36.95 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  37.57 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  37.17 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  33.7 
 
 		 232 aa  99  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.47 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  35.75 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  34.86 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  26.95 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  25.51 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  23.59 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  24.49 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  23.98 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  25 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  23.59 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  23.39 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  23.39 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  23.39 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  23.39 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  28.24 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  34.51 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.85 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  31.79 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  27.37 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  28.82 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  26.62 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  40.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  31.86 
 
 		 174 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  28.48 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  24.85 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  31.25 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  37.84 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 170 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  36.25 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  37.35 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  27.96 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  30.97 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  30.54 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  28.31 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  26.54 
 
 		 175 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  23.67 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 136 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>