122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3006 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  51.38 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  43.78 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  41.21 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  38.12 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  34.46 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  34.24 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 190 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  31.67 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  35.36 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  33.15 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  31.89 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 210 aa  93.6  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  33.53 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 196 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  29.83 
 
 		 206 aa  85.1  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  32.74 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  27.93 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  28.4 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  20.95 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  25.58 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  30.61 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  36.62 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  36.62 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  32.47 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  32.47 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  32.47 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  37.8 
 
 		 168 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  30.17 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  26.67 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  18.62 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  23.31 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 111 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28.79 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  28.75 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.72 
 
 		 114 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  41.77 
 
 		 277 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  24.28 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 115 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  25.14 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 		 112 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 114 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  30.21 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  34.12 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 263 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  43.24 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  22.67 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 122 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  51.02 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>