96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0295 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  231  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  53.4 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  50.94 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  55.45 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  46.39 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  46.32 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  45.36 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  52.08 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  52.08 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  45.36 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  51.04 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  51.04 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  51.04 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  46.81 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  45.36 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  51.04 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  42.7 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  42.17 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  38.14 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  43.9 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  36.46 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  41 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  42.05 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  39.33 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  34.83 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  36.26 
 
 		 271 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  35.94 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 240 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  29.73 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1057  hypothetical protein  64.52 
 
 		 38 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.490589999999999e-38 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1058  transcriptional regulator, PadR family  35.09 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.53908e-38 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 236 aa  43.5  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  31.94 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 119 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  28.74 
 
 		 123 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 220 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 213 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 220 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  32.86 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 316 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  34.33 
 
 		 263 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1595  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  28 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  28 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  28 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  28 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 236 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 217 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 189 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>