44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1678 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  48.31 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  45.56 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  45.56 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  46.07 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  44.94 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  44.94 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  44.94 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  38 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  42.05 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  35.51 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  41.76 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  36.46 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  31.46 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  29.21 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>